Почему А. А. Шахматова называют выдающимся лингвистем

Потому что он является основоположником исторического изучения русского литературного языка. Он ачал научную деятельность в рамках Московской филологической школы, но со временем разработал собственные исследовательские методы. Так-же много занимался изучением древнерусских летописей, заложил основы текстологического исследования и тем самым создал фундамент текстологии как науки. Установил время создания и источники старейших летописных сводов, в частности Повести временных лет.