ФлЕйтовый-флейтОвый - функция ударения

Флейтовый на е, так как флейта

Не о том вопрос.

акцентология изучает о собенности и функции ударения.

Целый ряд вариантов ударения связан с профессиональной сферой употребления. Есть слова, специфическое ударение в которых традиционно принято только в узкопрофессиональной среде, в любой другой обстановке оно воспринимается как ошибка.

мы говорим - флЕйтовый, а у музыкантов допускается и флейтОвый