Почему калашников не рассказал царю всю правду про кирибеевича

Потому что это ничего не поменяло бы. Опричнина - это целенаправленно придуманная самим царём система, при которой опричники - люди первого сорта, так сказать, "передовой отряд партии", а все остальные - второго. Целью опричнины был террор, и они имели карт-бланш на любые преступления. А если людишки начнут защищаться или мстить - никакого террора не получится. Поэтому поднявшего руку на опричника казнили без суда и следствия.

Он не мог рассказать всё царю, т. к. во-первых он не хотел, чтобы кто-либо узнал о его позоре, а во-вторых, если бы Калашников рассказал царю, что причиной всего была Алёна Дмитриевна, то царь мог бы её серьезно наказать.