Почему тема "отцов и детей" часто присутствует во многих произведениях литературы?

Потому что понимание именно отца и сына это самое главное

Семья - это первая ячейка, благодаря которой человек начинает знакомиться с первыми знаниями о жизни, окружающем мире, отношениях. А после у него уже формируется собственный взгляд, который основывается на семейных ценностях, обычаях, традициях. Поэтому часто человек относится к окружающим его людям так, как относились друг к другу у него в семье. Нравственные качества детей тоже зависят от их родителей.