Во второй половине 16 века развитие сельского хозяйства замедлилось и даже испытывало упадок. Какова причина?

В основном из-за опричнины, которая разделяла страну на две части: "Опричнина" во главе с Иваном 4 и "Земщина" во главе с боярской думой. Боярская дума своевольничала и развивала террор по всей стране. Последствия опричнины: Хозяйственное разорение страны и Начало государственного закрепощения крестьян.

Опричнина и параноя Ивана Грозного (боялся предательсв и покушений на его жизнь), как следствие доносы (в основном корыстные). Ну и опричники забирали у крестьян в их отсутствие земл, иногда жен.