Почему клеточные структуры называют органоидами а не органами?

Потому что между ними существует "разделение труда": каждый органоид выполняет свою функцию, и в соответствии с этим имеет свои особенности строения.

Органоиды (от орган и греч. éidos - вид), или органеллы - в цитологии постоянные структуры клеток. Каждый органоид осуществляет определённые функции, жизненно необходимые для клетки. Термин "Органоиды" объясняется сопоставлением этих компонентов клетки с органами многоклеточного организма. Органоиды противопоставляют временным включениям клетки, которые появляются и исчезают в процессе обмена веществ.