В чем различие сцепления с X и Y хромосомой?

В том что признаки которые лежат на Х-хромосоме могут передаваться как девочкам так и мальчикам, а признаки на У-хромосоме будут передоваться только от отца к мальчику, девочки эти хромосому не наследует.

У человека Y-хромосома гораздо меньше, чем Х-хромосома, поэтому она не содержит некоторые гены. Эти гены у мужчин имеются только в одном экземпляре (в Х-хромосоме), поэтому они всегда проявляются, даже если они рецессивные. Например, по гемофилии женщина может быть нормальной Х Н Х Н, носительницей Х Н Х h и больной X h X h, а мужчина - только здоровый X H Y или больной X h Y.

Это полный ответ, а так различие имеется в размере