будет ли проходить естественный отбор в гомогенной популяции, состящей из однородных особей, например, у дочерних растений вегетативно размножившихся злаков

По идее - нет! Но часть растений может погибнуть в связи с ещё одной состовляющей движущих сил - это борьба с абиотическими факторами.

К примеру, ты отрезала от злака лист, он пророс, притом он копия материнского организма, но он недостаточно вырос, чтобы в полной мере защититься от факторов неживой природы! Так что среди молодого поколения все может быть)

Отбор в гомозиготной популяции или среди клонов крайне мало эффективен. Не из чего выбирать. Теоретически будет, мутации никто не отменял, практически - нет. Бессмысленно вести отбор в чистой линии.